Efter en HHX-eksamen fra Struer Erhvervsskole blev Morten Illum Skaarup elev i Danske Banks afdeling på Trøjborg i Aarhus 2002-2004, og kom via ansættelse i bankens Marselisborg-afdeling til Universitetsafdelingen på Stjernepladsen, først som rådgiver, siden som souschef og afsluttende som leder af afdelingen.